2014年5月9日金曜日

小保方さんの脱力系実験ノートに想う

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すごい実験ノートが出てきました。
悪意・悪意って言ってますが、
このノート知ってて、再現実験の検証やるって言ってる理研は悪意あるわな。

















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2014年5月8日木曜日

小保方さんって超恵まれてるコース歩んでるんな

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研究者になりたい人にアドバイスできる有利なコースってのがあるけど、
小保方さん、完全にこのコースに乗ってるんだよな。
(大学院入りたてではわからんだろうけど)


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2014年5月1日木曜日

最近のボット対策についていけてない→裏にAI(人工知能)の急速な進化があった

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GoogleとかYahooとかのアカウント作成時に出てくるボット対策に最近、ついていけないと感じております。
下のキャプチャ画像はGoogleアカウントを作成するときにロボットでないことを証明するために入力を要求される例です。


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2014年4月29日火曜日

全員捏造犯として疑われる時代

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小保方さんの件は何故か石井俊輔調査委員長に飛び火して、なぜか山中教授まで巻き込もうとしている。


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2014年4月26日土曜日

石井元委員長ラボからの"切り貼り"論文

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石井俊輔元委員長のラボでバンドの切り貼りが見つかったとのこと。

すぐさま、調査委員長を辞任して、ラボのホームページに詳細について掲示した。実験ノートを示して、実際に実験事実があったと主張している。


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2014年4月22日火曜日

小保方さんに対する仲野徹・大阪大学生命機能研究科長のコメントまとめ

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近藤滋さんも所属する大阪大学大学院生命機能研究科の研究科長に就任した仲野徹さんは連日、小保方さんに苦しめられていますw



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2014年4月18日金曜日

笹井さんと旧知の近藤滋大阪大学教授のコメントまとめ

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笹井さんは見事に素人の記者を煙に巻きました。巧みに質問の趣旨をずらし、核心部への質問をかわしきったようです。

笹井さんと同門の大阪大学教授・近藤滋さんが今回の件を的確にずばっと斬っております。
笹井さんも近藤さんも京大大学院医学研究科で中西研と本庶研という極めて近い距離にいた旧知とのこと。

近藤滋さんの写真




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2014年4月14日月曜日

小保方さん、科学ってのはプロセスを楽しむもんだよ

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小保方さんの件について研究者と一般の人との間の乖離がはげしい。
科学者クラスタの小保方アレルギーは激しいし、呆れ果てた末、最近は傍観気味ですらある。なんでそうなるか考えてみると、私自身も科学は結果だ結果だと言いつつも、本当のところプロセスの重要性を痛いほど感じているのだ。


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2014年4月13日日曜日

Bloggerで全記事一覧を作る

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全記事一覧があると、俯瞰的にブログ記事が探せて便利です。
今回、固定ページに全投稿一覧を作ったので、覚え書きとしてメモしときます。

https://www.blogger.com/feeds/自分のblogger ID/posts/default?max-results=9999

でブログのfeedが見えることを確認(アドレスバーにコピペしてみると確認できる。Chromeだと見える。Safariは不可)


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2014年4月9日水曜日

STAP問題はサイエンスから法廷へ

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STAP問題はもうサイエンスとしての解決は見ないと思います。
完全に法廷闘争(かけひき)に移行したと思います。
科学的真実はもう日の目を見るチャンスはなくなりました。


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2014年4月7日月曜日

STAP細胞の検証に1300万円もかけるってどうかしてるぞ

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理研の暴走が止まらない。

ノートが3年で2冊で日付は曖昧、パソコンデータは押収できず、論文に載っている全てのデータの足取りを追うことはできていない。
過去にたった1件だけの捏造事件の調査をおこなったにもかかわらず、『私の経験では』としたり顔で語る石井委員長。
理研より出てくる情報を鵜呑みするしかない不勉強なマスコミ。


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2014年4月6日日曜日

ストーリーに固執しすぎる研究者

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生命科学分野ではストーリーに固執しすぎる研究者が多くいます。

私はストーリーなど人を説得するためのものに過ぎないと思っていて
実はそれほど重要だとは考えていません。


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2014年4月3日木曜日

死にかけた細胞からのOCT4の発現はよく知られていること

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死にかけた細胞からのOCT4が発現することは実は
昔から、結構知られていることです。

死にかけ(死んだ)細胞ではクロマチンもゆるゆるになり、
本来発現されるべきでない蛋白質が発現されるようです。
(ちょうどセルフリーシステムのような感じ)


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2014年4月1日火曜日

理研の大迷走、小保方騒動はどうなるの?

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迷走は止まらない。飽きたけど

マスコミの報道やSNSの反応を見てると
もの凄く違和感を感じることがたまにある。
論文はまずかったかもしれないが、STAP現象はあるかもしれないという。
理研自体が同じようなことを言っているから始末が悪い。

STAP細胞なんて無い
何故これがわからんのだろうか?


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2014年3月31日月曜日

研究費を獲る=それは期待を売ること

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科学研究を続けていく上で最も難しいことのひとつは、
研究費を獲得しつづけることだ。

持続的に良い研究をしようとすると、
どうしても持続的に研究費を得る必要がある。


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2014年3月25日火曜日

改竄・捏造した者たちの勝利

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小保方さんの問題が示したことの最も危険な側面は、
キャリア形成において、
改竄・捏造した者たちの大勝利であるということ。


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2014年3月22日土曜日

ビッグラボ化は研究の質を下げる

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今年度から始まるImPACT(革新的研究開発推進プログラム)は
予算総額550億円で5~10件のプロジェクトを採択する予定(期間は5年)。

単純計算で一件あたり50〜100億円。
一件一年あたり10〜20億円。

これはひどいことが起きそうです。
政府の人間は大きなお金をつっこめば、
大きな成果を得られると勘違いしているようです。

研究費とインパクトのある論文の出版数の関係の調査結果を紹介したいと思います。
NIHのサイトからの引用です。


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2014年3月21日金曜日

小保方さんって全く実験やってないってさ

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何故そう思うかというと、
実験を毎日のようにやっていたとしたら、
それなりにデータは溜まります。


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2014年3月20日木曜日

1100兆円の国債をどうやって返すか?

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日本は1100兆円を超える国債を抱えている訳です。
これをどうやって返すのか?

で、現状把握すると、利率加重平均は

1.19%

http://www.mof.go.jp/jgbs/reference/appendix/2303zandaka04.pdf
今借りている借金の平均利率をしめしています。


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2014年3月18日火曜日

理研ってめちゃめちゃ恵まれた研究機関なんですぜ

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理研って研究環境としてはめちゃめちゃ恵まれた機関です。

チームリーダーになると年間約1億円近くの研究費がもらえますから、
大学で研究やってるのがばからしくなります。


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若山さんが第三者機関に送ったSTAP幹細胞によって全てが明らかになる

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小保方さんが若山さんに渡した細胞何かということが第三者機関の解析で明らかになるでしょう。
次世代シーケンサーで丁寧に全ゲノムを読んでしまえば、その細胞の由来は丸肌になります。


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2014年3月14日金曜日

STAP細胞疑惑に関する理研の中間報告会見のずさんさ

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まあ組織防衛上そうなるのでしょうが、
今日の理研の会見はひどかった。


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2014年3月12日水曜日

STAP細胞で、理研も追いつめられてますね〜

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科技会議:理研、特定法人先送り STAP問題注視
これは理研にとってかなり重大局面です。
組織防衛をしようとしたがために、逆にピンチに追い込まれています。

理研にとって特定国立研究開発法人に指定されることは非常に重要なことでした。
それがSTAP細胞の疑惑によって無に帰するかもしれないわけです。


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2014年3月10日月曜日

生暖かく見守ってきたSTAP細胞でしたが、ついに最終局面を迎えそうです。

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ついに決定的な捏造の証拠が出てしまいました。

11次元さんの第一報


同時に中日新聞も博士論文を入手し、同じことを報じています。
http://iryou.chunichi.co.jp/article/detail/20140310064205490 


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2014年3月1日土曜日

ロシアのウクライナ侵攻と北朝鮮のミサイル発射

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ロシアのウクライナ侵攻と北朝鮮のミサイル発射は全く独立に発生したように見えて実は、裏で通じ合ってると予想。


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2014年2月27日木曜日

STAP細胞もうあかんのやろうなぁ

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STAP細胞の再現性について、
難しい技術だからとか”、
特許がからんでるからとか”、
擁護する向きがあるが、
理研CDB内で再現実験を行えばよいだけ


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2014年2月25日火曜日

結局、小保方さんのSTAP細胞は本物なの?

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色々、調べてみましたが、
結局、小保方さんのSTAP細胞が本物かどうかは
↓を信じることができるかどうかだということです。

結論:
爆発して内容物が飛び出した細胞が復活して、STAP細胞へ


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2014年2月21日金曜日

小保方ミステリー劇場

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世界中で追試が行われており、STAP細胞の検証サイトでは10件中10件とも失敗という結果に。
Nature誌独自の調査でも10研究室ほどがトライしていてうまくいっていないとのこと。
(捏造説の勢いが止まりません。理研は会見を!)


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2014年2月20日木曜日

情強の君は勝ち組か

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良くネット上で情弱はいろいろ損しているといっているが、
結局、調べたり、比較したりする時間ってコストだろうと思う。

お金がない人はそうせざるを得ないわけで、
時間を費やして、安いものを探す訳である。


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2014年2月19日水曜日

科学行政・大型プロジェクトはこうして生まれる。

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経産省系や総務省系のプロジェクトは驚くほどいい加減に決まります。

基本的に官僚はプロジェクトを立ち上げることはありますが、それが成果を生むかどうかわかる時点では違う部署に移っています

つまり、責任を負う必要がないのです。

そういうわけで、官僚は、できるだけ大規模なプロジェクトを始めようとします。

流れとしてはこんなかんじです。

官僚が実績作りに何かしたくなる。

面白そうな研究、有名な教授を探してきて

相談 + 丸投げ

数百億のプロジェクトの絵が描かれて

たまたま予算枠に通ると

プロジェクトが走り出す!

こういった形のプロジェクトはNEDOやNICTなど研究者の監視がゆきとどかないところで生じています。

予算策定の経過が不透明、人選と予算規模が不適当。

予算規模が大きくなればなるほど
その詳細はいい加減になります。

小口でたくさんの研究者に予算をつけた方がよほど生産的でしょう。
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2014年2月17日月曜日

小保方さんの捏造騒動について

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小保方さんのSTAP細胞発見の報道から2週間、もう捏造騒ぎになっています。

過去のバンドの切り貼りは黒!

捏造ではないと信じたいですが、
小保方さんの過去の論文における
バンドの切り貼りは、
完全に黒です。
この手口、過去にもさまざまな捏造論文でも行われている古典的な手法です。
しかも、科学者のキャリアをスタート時点、つまり博士論文ですでに手を染めています。


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2014年2月12日水曜日

インパクトを考えて研究する

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インパクトを考えて研究すること。
これって結構大切です。

アカデミアの雰囲気としては、そのような不純な動機で研究するなんてとんでもないといった感じかもしれませんが。

でも、今時、社会にインパクトを与えられない研究は淘汰されていくと思います。
すでに助教のポジションはパーマネントではありませんし。(ほとんどの大学でそうです。)
自分の趣味的研究だけを永遠と行うことなどできない環境になってきています。
万年助手(今の助教)みたいな人は存在することができなくなります。

問題意識のない研究を何十年も情熱を維持して続けることなどそもそもできないわけで、
趣味的研究を行ってきてなんの成果もださない研究者は象牙の塔にこもって孤高をきどっているだけにすぎません。

何も実学指向の研究をせよとJSTみたいにつまらないことをいう気はありません。
基礎研究の方が将来的には大きな果実を生みます。これはあきらか。

インパクトを世界に与える研究をすべきだと。
インパクトとはなにかと問われるなら、せめてNatureやScienceに論文を出版できるような研究をすべきだと思います。

人は弱い生き物なのかともすれば、易きに流れます。
自分が取り組んでいる研究が、つまらないことだと途中で気づいたとき、すぐにそれをやめて他に取り組むということは普通の人はできません。
なんとか面白い点はないかとその周辺をウロウロします。
でも、面白くないものは面白くないと気づかねばなりません。
それほど、我々に与えられた時間は多くないのです。

面白くない研究をずるずると引きずって、キャリアをつぶしているポスドクをたくさん見てきました。

そういったときに、俯瞰的に自分の研究を見る必要があります。
自分の研究ははたしてインパクトがあるのだろうかと。
そこで行動できるかどうかが研究者としての生死を分けるのだと思います。
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2014年1月23日木曜日

怪しいサイエンスが良いサイエンスだ

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タイトルの通り、怪しくて危うくて、ピンと来ない研究が良い研究という話。

昨今では、「わかりやすい」ということが正義である。
アカデミアでもその傾向は先鋭化しており、
まず、飯の種である研究費の獲得からしてそうである。


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2014年1月21日火曜日

武田薬品工業に就職したいなと思ってる君へ(年収とか資本主義とか)

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生命科学系を専攻している修士や博士課程の学生に人気と言えば製薬会社でしょう(知らんけど)。
しかも、その中で日本一の製薬会社といえば武田。


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2014年1月13日月曜日

ウォーレン・バフェットの投資の本質

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ウォーレン・バフェットの投資の本質って、
長期安定銘柄をレバレッジ2倍で長期保有という戦略ですよね。


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2013年12月28日土曜日

続報 次世代シーケンサーの精度

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2013年4月のPLOS ONEの論文
Revising a Personal Genome by Comparing and Combining Data from Two Different Sequencing Platforms

同じゲノムDNAを2つの次世代シーケンサーで読みましたという論文
使ったシーケンサーはSOLiDとイルミナ。
SOLiDで330万個、イルミナで362万個のSNVs(single nucleotide variants、DNA塩基配列の変異)を見つけた。
そのうち300万個は共通だったが、両方ともリファレンス配列と異なるものが6.8万個、illumina-specificなものが51万個、SOLiD-specificなものが21.9万個となっている。
つまり、1つのシーケンサー方式では、10%程度の間違いを生む可能性があるということ。

驚くほどのエラー率。
調べてみて初めて知った。
研究の現場では次世代シーケンサーを使うことはまだ普及していない、それが実感だ。
知りたい特定の遺伝子の配列だったら、PCRして、従来型のキャピラリーシーケンサーで読めば良いだけである。


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次世代シーケンサーの精度の話

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ちょっと前の論文なので、状況はより改善されているかもしれませんが。

2012年1月にNature Biotechnology に発表された論文
タイトルは
Optimized filtering reduces the error rate in detecting genomic variants by short-read sequencing.
http://www.nature.com/nbt/journal/v30/n1/full/nbt.2053.html

この実験では、ゲノム情報が全く同じはずの一卵性双生児の白血球から抽出したゲノムを利用して、2つのゲノムから得られたDNA断片をおのおの独立にリファレンス配列(既知のゲノム配列)にアライメントした。
(体細胞変異が起こる可能性は否定できないが、確率は20億分の1程度)


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2013年12月24日火曜日

あかんやろコレ!沖縄科学技術大学院大学(OIST)がバブってる

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http://ryukyushimpo.jp/news/storyid-216896-storytopic-3.html

大学院大、教授300人に 予算も確保、要望応え

(1)世界最高水準の機関にふさわしい規模、教授陣300人規模への拡充 (現在50人)

(2)14年度以降の200億円規模の予算確保

(3)研究結果を活用した知的産業集積の形成に向けた施策

これはあかんやろ!
と言う感じにきな臭くなってきましたね。

学長はJonathan Dorfanというもと素粒子科学者。
スタンフォードの線形加速器のディレクターだった人ですね。

この学長、年収6000万円であるとhttp://mitsuhiro.exblog.jp/17060709/

OISTは完全に外人の食い物になりつつありますね。
普天間基地などの基地負担を押し付けている代償として国民が払い続けている訳です。
(沖縄県の仲井真弘多知事が辺野古(沖縄県名護市)の埋め立て申請を承認した代償だったんですね)
でも、この大学、ほとんど沖縄人のためにはなっていませんね。
そもそも、お金自体が沖縄に落ちるわけではない。
つまり、沖縄経済は潤わない。

しかも、世界中から研究者を呼んでいるとのことですが、ほとんどは2流の研究者ばかりです。
一流研究者がわざわざ、アメリカやイギリスを離れて、日本の沖縄なんて場所で研究室を主催したいと思う分けないでしょうが!

選考過程もかなり不明瞭で、何故こんな人を採用したんだろうという人ばかりです。(特に外人研究者はそんなのばかり)

もういい加減、こんな茶番劇やめればいいのに。

でも国策ならOISTは、富める者がより富むサイクルに突入しているわけで、
皆でOISTニイキマショウトイウコトデ。

中国の不動産バブルを見ている感じでしょうか。いつかははじけるけど、それまでは皆ハッピーw

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2013年12月4日水曜日

2300万円支給の若手研究者を倍増 文科省が支援策拡充

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2300万円支給の若手研究者を倍増 文科省が支援策拡充 

http://www.nikkei.com/article/DGXNZO63499990S3A201C1TJM000/

2300万円は研究費ですからねお間違いなく。

この流れは当分続くだろうね。

どう考えたって、現状の若手のポスト難は将来的に損失だろうし。
振れた振り子は逆に振れるもんです。

ただ、テニュアトラックなので、その中で勝ち残らなければなりません。
若手研究者のハイスッペク化が静かにおこっていくでしょう。

今、現役の教授ってすごい人もいますけど、とんでもないのもいますから。


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2013年12月1日日曜日

自信がないとういう病

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自信がないとか、将来が不安であるとか。

最近の学生さんを見てると”自信がないという病”に罹患しているように見えます。

誰しも最初から自信があるわけはありません。
培っていくものです。

ちょっと賢ぶって、統計的には大企業に入社したほうが、生涯年収がいくら高いとかいいますが、ほとんど誤差です。
しかも、個々人の将来なんてわかるわけないのです(統計的に見る事にほとんど意味はありません)。

大企業でも倒産すればそれまでですし、会社内の主流からはずれたら、それはそれでつらい。

安定した仕事に就きたいといいますが、
公務員にしても大企業にしてもその競争率はめちゃくちゃ高いわけです。

その就職戦線に勝利しても、仕事が楽しい訳ではないのです(公務員の仕事なんて、楽でしょうが、楽しくはないですよね)。

安定は面白いということと対極にあります。

研究でもそうです。実用研究にはロマンはありません。来る日も来る日も、網羅的に物質をかえて実験してといった作業の繰り返しです。必要性はあります。誰かがやらなければならない仕事ですがね。

企業の創薬も、候補物質のスクリーニングにつぐスクリーニングです。アイデアを試す機会はほとんどありません。時間・経済効率性が問われるわけで、面白い訳ありません。
全てはトレードオフです。

面白いなと思う事を単純にやってみることが吉です。
迷ってる間に人生終わっちゃいますしね。

今日は、アカデミアに進むことを煽ってみました。
(アカデミアでなくてもいいんですがね。ベンチャー立ち上げるとかもおもしろそう。)
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